ࡱ                >  	               )          *          (   ܥh _    e              ?,  N                  ?)                                   <  p    <  p   p<      p<      p<      p<      p<     
=      
=      
=      
=      
=      
=  
   =  (   
=      LM  7   <=      <=      <=      <=      <=      <=      <=      <=      NK     PK      PK      PK  6   K     ZL     .M     M  X   M  0   LM                      p<      >            <=      <=                      >      >      LM      K      p<      p<      <=                      <=      K      K      K      >  :  p<      <=      p<      <=      NK              `1FyY<  2   <  T   p<      p<      p<      p<      <=    NK      K  :   K                                                                                            
 Mendelova zemdlsk a lesnick univerzita v Brn
 Agronomick fakulta
 stav chovu hospodskch zvat







 Zpesnn odhadu plemenn hodnoty


 Ing. Josef Kuera








kolitel : Prof. Ing. Jaroslav Mikk, DrSc.










Cl prce
 V poslednch letech je stle vce pozornosti ve vtin
lechtitelskch, resp. seleknch programech vnovno zpes-
nn odhadu plemenn hodnoty zvat.
 Rychl rozvoj vpoetn techniky odpovdajc kapacity
a rychlosti a matematicko - statistickch metod souasn se
zkvalitnnm rovn veden zznam v kontrole uitkovosti
jsou zkladn podmnky pro zskn pesnjch odhad.
 Hlavnm clem prce je pispt ke zven pesnosti odha-
du plemennch hodnot bk a krav pro vybran ukazatele ml-
n uitkovosti (kg mlka, tuku a blkovin) pouitm metody
ANIMAL MODEL v populaci eskho strakatho skotu v esk re-
publice. Vsledky prce by mly bt ve spoluprci se Sttnm
plemenskm podnikem nsledn vyuity pi pravch stvaj-
cho modelu odhadu plemenn hodnoty. Pozornost bude zamena
pedevm na efekt HYS - stdo, rok, obdob.
Literrn pehled
 Hlavnm clem plemenitby hospodskch zvat je rozmno-
it genotypy nejlepch plemenk a plemenic z populace
vzhledem ke zkvalitnn nsledujc generace.
 Z genetiky kvantitativnch vlastnost je znm, e geno-
typ kadho jedince je podmnn aditivnm inkem gen, do-
minanc a interakc alel. Proto je z hlediska genotypov
promnlivosti rozliovna veobecn a speciln plemenn
hodnota (KLIMENT et.al. 1985).
 Odhad plemenn hodnoty se me uskuteovat nkolika
zpsoby:
 - podle uitkovosti pedk (rodokmenn hodnota)
 - podle uitkovosti sourozenc a polosourozenc
 - podle uitkovosti vlastn
 - podle uitkovosti potomstva
Informace o vlastn uitkovosti resp. informace o uitkovo-
sti pbuznch nebo potomstva jsou zkladem pi vlastnm v-
potu plemenn hodnoty (KENNEDY 1995)
 SIMIANER (1985) z hlediska genetiky definuje plemennou
hodnotu jako sumu prmrnch efekt gen (aditivn sloku).
Jednotliv inky gen dl na aditivn, dominantn a epi-
statick.
Pi vyjden celkov fenotypov hodnoty P meme potom
vychzet z rovnice:
 P = G + E resp.
 P = A + D + I + E
G = genotyp
A = aditivn sloka ( plemenn hodnota )
D = dominantn sloka
I = epistatick sloka
E = prosted
 Odhad plemenn hodnoty je ovlivovn celou adou faktor.
Veobecn je lze rozdlit na faktory genetick
a negenetick, ppadn zohlednit jejich mon interakce
(CANDRK 1995).
 ERMK (1995) uvd nutnost zohlednn vech identifiko-
vatelnch a mitelnch vliv, pedevm negenetickch, kte-
r psob na rove namen uitkovosti (vliv stda, roku,
sezony, vivy, vku pi prvnm otelen, stadia reprodukn-
ho cyklu atd. ) Vlivem rznch faktor se zabval tak JAN-
SEN, DOMMERHOLT ( cit in CANDRK 1995), SCHAEFFER (1995 ),
WIGGANS (1994), RNNINGEN, VAN VLECK ( in CHAPMAN 1985).
 Pi vlastnm vpotu plemenn hodnoty jsou sestaveny
a nsledn eeny rovnice smenho modelu, vychzej z pr-
ce HENDERSONA (1953, 1975, 1984) cit in KENNEDY (1995). Sm-
en model meme vyjdit v nsledujcm tvaru:
 Y = X b + Z a + e
Y = vektor pozorovn
X = matice pevnch efekt
b = vektor pevnch efekt
Z = matice nhodnch efekt
a = vektor nhodnch efekt
e = reziduln efekty (SCHAEFFER 1993)
 KLATOVSK, URBAN ( in CANDRK 1995) vyjaduj pednosti
animal modelu, kter spovaj v jeho schopnosti pizpsobit
se clenmu pipaovn plemenk a plemenic a zohlednit
aditivn genetick vztahy mezi jednotlivmi zvaty. V rov-
nici vpotu animal modelu je pak vyuito t zdroj infor-
mac pouitch k hodnocen zvete: - informace o rodich
 - informace o vlastn uitkovosti
 - informace o potomstvu.
Zkladem vech aplikac animal modelu je puit matice p-
buznosti A. Prvky lec na jej diagonle pedstavuj 1 +
Fx, kde Fx je koeficient pbuzensk plemenitby podle Wrigh-
ta.
 Vpotov strategie a postupy pedstavuj samostatnou ka-
pitolu pi vyuvn animal modelu. Jedna z nejastji pou-
vanch je strategie, kterou popisuje KENNEDY ( cit in CAN-
DRK 1995), SCHAEFFER (1995). Uvdn postup nat hodnoce-
n a rodokmenov znaky v kadm iteranm cyklu.
 Pro vlastn vpoet je v souasn dob monost rozhodnout
se mezi celou adou programovch balk. Programy je mon
obecn rozdlit na dv skupiny
 - pro een malch soubor
 (10 000 - 100 000 rovnic)
 - pro een velkch soubor
 (vce ne 100 000 rovnic)
Podle potu hodnocench znak na single - trait ( hodnotc
jeden znak) a multi - trait (hodnotc vce znak souasn).
 Pro genetick hodnocen jsou v souasn dob pouvny
nejastji nsledujc programov balky: GENEV (KOVCS,
SZEGDI 1994), BVEST (GILMOUR 1994), MTDFREML (KRIESE et al
1994), LSML - Harvey, DFREML - Meyer, PEST & VCE, JAA-MTC,
ABTK, DMU (CANDRK 1995 ). Pro vukov ely je mon vyut
program PEDIGREE VIEWER (KINGHORN 1994). st uvedench
programovch balk je dostupn na FTP serverech prosted-
nictvm potaov st INTERNET.

Materil a metodika
 Zkladn pouit materil tvo daje o sti ijc po-
pulace krav a bk eskho strakatho plemene v esk repub-
lice. Populace je rozdlena do sedmi soubor. Zkladn roz-
dlen je provedeno podle regionu chovatele ( odpovd bva-
lm krajm ). O jednotlivch zvatech byly shromdny nk-
ter rodokmenn, identifikan a produkn daje z evidence
kontroly uitkovosti (slo plemenice, chovatel, otec linie
a registr, vrobn oblast, poad laktace, vk pi prvnm
otelen, servis perioda, produkce mlka v kg, % tuku a bl-
kovin, kg tuku a blkovin...) veden Sttnm plemenskm
podnikem v Praze, resp. jeho pracovitm vpoetn techniky
v Beneov. Soubor zahrnuje obdob 1989 - 1994. Po transfor-
maci zskanch daj do tvaru .DBF soubor bylo provedeno
rozlenn podle plemenn pslunosti (C1 - C3, H1 - H4).
Vpoet zkladnch statistickch ukazatel je nutnm krokem
pro analyzovn jednotlivch parametr v populaci. Do vpo-
t byly zahrnuty normovan laktace, kter doshly produkce
minimln 1 500 kg mlka. Dal fze zahrnuje ppravu zk-
ladnch soubor krav, bk a laktac, kter do vpotu vstu-
puj. Vpoet bude proveden pomoc programu JAA20, kontroln
vpoet potom programem, kter poskytlo Kanadsk ministerst-
vo zemdlstv Vysok kole ponohospodrsk v Nitre.
 Data v souborech jsou uspodvna podle chovatele a sla
zvete, v souboru laktac i podle poad laktace v rmci
chovatele. Nutn je systm kontroly vstupnch daj, aby by-
lo zabrnno monosti duplicity daj ap. Dleitm krokem
bude ve spoluprci se SPP Praha, stediskem Beneov doplnn
souboru bk o maximln poet dostupnch rodokmenovch
a plemennch hodnot.
 V ppad chybjcch rodi budou tito vyjdeni slem
genetick skupiny, ze kterch bude sestavena matice genetic-
kch skupin. Genetick skupiny jsou sestavovny na zklad
roku narozen zvete generanch interval platnch pro
sledovanou populaci. V rmci kadho chovatele bude sledovn
rok otelen a sezona otelen. Pi rozhodovn o potu sezon
otelen mohou poslouit jako podklad daje potench ana-
lz. Pro kad zve ( krvu i bka) se zjist skuten po-
et dcer a syn, kte se nachzej ve sledovan populaci.
Pro daje, kter budou vstupovat do vpot, je teba zvolit
nejvhodnj systm pedkorekce - a to pepotem na standar-
tizovan jednotky. CANDRK (1995) uvd jako pklad jednot-
ky BCA ( Breed Class Average ),nebo pomoc pedkorekc, kte-
r jsou zaazeny pmo do hodnotcho modelu.
 Vhodou pouit standard me bt men rozsah soubor
a tm pozdji spora strojovho asu a celkov zrychlen v-
pot.
 Iteran fze bude pedstavovat jdro celho vpotu ple-
mennch hodnot. V jejm prbhu budou opakovan vypotvna
een pro jednotliv zvata. Cel iteran vpoet een
programem JAA20, je nastaven na zvolen poet krok a sub-
kol a je ukonen, kdy mezi starmi a novmi hodnotami nen
rozdl pekraujc stanovenou konvergentn hodnotu, nebo je
mon nastavit dobu vpotu. Na zvr budou vypotny jed-
notliv prmry genetick zkladny a sestaveno poad hodno-
cench zvat.

Seznam literatury

CANDRK, J. : Pouitie ANIMAL MODELU pre odhad plemenej hod-
 noty dobytka mliekovho uitkovho typu na Slovensku,
 Kandidtsk disertan prca, VP Nitra, 1995, 105 s.

ERMK, V. : Pednka " Vyuit Animal modelu pi odhadu
 plemenn hodnoty mln uitkovosti v R", MZLU Brno,
 1995
FALCONER, D. S. : Introduction to quantitative genetics.
 2nd ed. New York, Longman Inc. 1981, 365 s.
GILMOUR, A. R. : BVEST - Multi-trait Animal model breeding
 value software, In.: Proc. 5th World Congress on Gene-
 tics Applied to Livestock Production. Volume 22., Gu-
 elph, University of Guelph 1994, s. 57-58

CHAPMAN, A. B. - NEIMAN-SORENSEN, A. - TRIEBE, D. E. : World
 Animal Science - General and quantitative genetics,
 Elsevier Amsterdam, Oxford, New York, Tokyo 1985, 408
 s.
KENNEDY, B. W.: Quantitative genetics theory in animal bree-
 ding, University of Guelph, Guelph 1995, 220 s.
KINGHORN, B. P. : Pedigree Viewer - a graphical Utility for
 Browsing Pedigreed Data Set. In: Proc. 5th World
 Congress on Genetics Applied to Livestock Production.
 Volume 22., Guelph, University of Guelph 1994, s. 85
 - 86
KLIMENT, J. - KARSEK, V. - KBEK, A. - PENICA, J. - TIKA,
 O. :Veobecn zootechnika. 1. vydn Bratislava, Prro-
 da 1985, 508 s.
KOVACS, Z. - SZEGEDI, J. : GENEV - a multivariate BLUP
 package. In: Proc. 5th World Congress on Genetics
 Applied to Livestock Production. Volume 22., Guelph,
 University of Guelph 1994, s. 55 - 56
KRIESE, L. A. - BOLDMAN, K. G. - VAN VLECK, L. D. - KACHMAN,
 S.D. :MTDFREML - A flexibile set of programs to estima-
 te (Co)variances for messy multiple trait models using
 derivate-free REML and sparse matrix techniques In:
 Proc. 5th World Congress on Genetics Applied to Lives-
 tock Production. Volume 22., Guelph, University of Gu-
 elph 1994, s. 43 - 44
SCHAEFFER, L. R. : Linear Models and Computing Strategies in
 Animal Breeding, 168 s., University of Guelph, Guelph,
 Ontario 1993
SCHAEFFER, L. R. :Semin "Linear Models and Computing Stra-
 tegies in Animal Breeding", poznmky, VڎV Praha - Uh-
 nves and University of Guelph, 21.8 - 4.9. 1995
SIMIANER, H. : Das Tiermodell in der Zuchtwertschtzung mit
 BLUP, Gieen 1985, 137 s.
WIGGANS, G. R. : National genetic Improvement Programs for
 Dairy Cattle in the United States. J.Animal. Sci. .69,
 1991, s.3853 - 3860
  .A                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ?,  Y,                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        u ] c      4  I  k  l  m  n  o  p  q  r                                                  ,  i        <  s      &   p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p        x  -&  c        G  Y        3  p      	  7	  @	  q	  	  	  	  
  W
  }
  
  
  ,  6  n                  Q        
  @
  |
  
  
   p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p        x  -
  0  i        J  ]  s            ?  |      -  h          Y  ]        N          1  L  j        6  o      #  [   p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p        x  -[            D        6  r      "  ^        L         =  z      )  c        P  e        P        A  |      3    p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p        x  -3   p         !  !  V!  !  !  "  G"  "  "  "  #  
#  #   #  ]#  #  #  #  $  =$  C$  |$  $  $  %  S%  ~%  %  %  %  (&  ,&  i&  &  &  '  ?'  u'  {'  '  '  (   p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p        x  -(  9(  l(  (  (  )  ?)  w)  )  )  *  3*  p*  *  *  *  ++  _+  +  +  +  *,  ?,   p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p  p                                                                                                                                                                                                                                                                     x      K        @  Normln     a                   & A@ & Standardn psmo odstavce                ?)  	 ?,                               }        C!  '  ?)    
    8    '    "    ;    9               Y,      &  
  [  3   (  ?,        drhmmvO;0x#-+'`, ;RC genawAUTORPOZN	DATUMVYTV	DOBAPRAVNZSOUBVELSOUBKLSLOVULOILPOZNAKPOSTRPOSLOV	DATUMTISKSOUKROMODSLREV	DATUMULOPEDMTPOABLONANZEVPR
VLASTNOSTIDOKABECEDNARABSKVECHNAPRVNVELKSLOVKY
ZNAKFORMTKTEXT
PRVNVELKHEXMAL
VETNFORMTUADOVADTEXTMSKVELKABSROUNDDEFINEDINTANDFALSEMAXMINMODAVERAGECOUNTNOTORPRODUCTIFSIGNSUMTRUE                b  g  i  m              c  k          -  1  p  w                      S  U  '  *  L  V     	  	  
  
  
  ;
  >
  @
  B
  |
  
    
  W  Y                  Q  R  [  \          
  
  ?
  E
  
  
  
    &  +  -  1                  $  &  R  W                  	    E  L  N  P                                    
  =  B  D  I  {  ~                                              7  ;  =  B  i  n                                             	              3  5  <  A  B  G  H  O  ^  i  k  n  p  r      Q  T  V  ]               .   6   E   H   O   W   k   u                     U!  a!  e!  q!  r!  {!  !  !  !  !  !  !  !  !  !  !  !  !  !  !  !  !  !  !  !  !  !  !  "  	"  
"  "  "  !"  ""  )"  -"  6"  7"  B"  O"  Q"  T"  X"  e"  g"  h"  n"  "  "  "  "  "  "  "  "  "  "  "  "  "  "  #  #  #  #  <#  H#  I#  Q#  R#  X#  Y#  [#  \#  b#  c#  g#  {#  }#  ~#  #  #  #  #  #  #  #  #  #  #  #  #  #  #  #  #  #  $  $  	$  $  $  $  $  %$  )$  2$  3$  >$  L$  R$  _$  a$  b$  h$  $  $  $  $  '%  3%  :%  B%  C%  E%  G%  L%  Q%  V%  W%  _%  c%  k%  m%  t%  x%  %  %  %  %  %  %  %  %  %  &  #&  (&  *&  +&  3&  7&  =&  @&  B&  G&  P&  U&  Z&  [&  c&  d&  i&  j&  p&  q&  v&  x&  &  &  &  &  &  &  &  &  &  &  &  &  &  &  &  &  &  &  &  &  &  &  &  &  &  &  &  &  &  '  '  '  '  '  '  '  !'  F'  L'  M'  S'  T'  W'  X'  a'  b'  l'  m'  o'  q'  w'  x'  '  '  '  '  '  '  '  '  '  '  '  '  '  '  '  '  '  '  '  '  (  (  
(  '(  )(  ,(  3(  4(  7(  C(  E(  F(  L(  n(  q(  r(  |(  }(  (  (  (  (  (  (  (  (  (  (  (  (  (  (  (  (  (  (  )  )  )  )  )  
)  )  )  )  )  #)  $)  &)  A)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           : Ladislav Zeman(E:\_PRACOVN\MENDEL.NET\1PRACE\KUCERA.602@HP LaserJet IIP Plus LPT1: HPPCL HP LaserJet IIP Plus HP LaserJet IIP Plus              @ g  	         ,  ,                                                                                 @ MSUDHP LaserJet IIP Plus                          d    HP LaserJet IIP Plus              @ g  	         ,  ,                                                                                 @ MSUDHP LaserJet IIP Plus                          d                        7  Times New Roman CE  Symbol & Arial CE "  A         ,&,&          "        H                      Y    0       Ladislav ZemanLadislav Zeman                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       	   
         
                                                             !   "   #   $   %   &   '   ,   4   R o o t   E n t r y   @             NF < @                      	           F     ف'xY`1FyY+   @  W o r d D o c u m e n t         _  w  9  ,  ,                                                       N       C o m p O b j                                                                                          j        S u m m a r y I n f o r m a t i o n                           (                                                                      
          
   	           F   dokument Microsoft Word 
   MSWordDoc    Word.Document.6 9q                                                         Oh +'0                                                        	          
   <     H  
   T     `     h     p     x              at:        d       Ladislav Zeman         A                Normal        Ladislav Zeman        2 A       Microsoft Word for Windows 95   @    F#    @    x D o c u m e n t S u m m a r y I n f o r m a t i o n           8                                      	                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ՜. +,0            H      P      `      h      p      x                          MZLU       ,     H                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         yY@    nByY              "                                                ՜. +,0            H      P      `      h      p      x                          MZLU       ,     H                                                                                                                                                                                                                                                                                         